益生菌主要作用是平衡肠道菌群，预防或缓解腹泻、便秘、胀气等肠道问题，还有助于提高免疫力。因益生菌是有益的活性微生物，可以调节黏膜与系统免疫功能，通过调节肠道内菌群平衡，促进营养吸收保持肠道健康的作用。
虽然现在研究结果证明益生菌是可以长期吃的，但是并不建议长期吃益生菌。人体菌群应该保持在平衡状态，因此益生菌并不是越多越好，过度摄入和补充益生菌不仅不能对人体产生积极作用，还有可能导致人体脏器负荷过重，产生严重的负面作用，从而严重扰乱肠道环境。
肠道如果对菌群耐受了，你吃再多的益生菌（正常量，不是当食物吃），也很难改变菌群平衡；而且大概率吃下去的益生菌不能定植了，也产生不了更多的作用。因为肠道的菌群最好是处于一个自我平衡状态，如果在正常状态下，总是从外界补充益生菌，也没啥意义，对于肠胃敏感的人，还容易破坏原有肠道菌群平衡。
但是，在肠胃欠佳或者需要肠胃较高负荷运转的状态下，建议适当补充。
需要注意的是，不过这都只是建议，具体情况还需要根据每个人的身体状况和健康需求来决定。如果有任何关于健康的问题，最好咨询医生或营养师的建议。。此外，食用益生菌也要根据个人体质进行调节，适量为宜，过量食用可能会对肠道造成不良反应。最后，寻找优质的益生菌食品也是长期食用的关键，建议选择口感好、品质高、菌活性强的产品。
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